يذكر الطغرائي في بداية مخطوطه سبب تأليفه له وهو عدم ترتيب أنواع العلوم عند الفلاسفة السابقين، وكذلك عدم وضوح معنى العمليات الكيميائية: والتي منها: إذابة المادة الصلبة في الماء أو غيره (الحلّ)، التفاعل الكيميائي للوصول إلى مادة جديدة (التركيب أو العقد) وغير ذلك. وذكر الكتاب اليونانيين القدماء أمثال: فيثاغورث، سقراط، أفلاطون، وهوميرس. ويذكر من المسلمين: خالد بن يزيد، جابر بن حيان، وأبو زكريا الرازي: فيورد أقوالهم في أصل تكون الأشياء في باطن الأرض. ويشرح هذه النظرية ويؤكد على أن أصل المعادن في الأرض والماء، ويعمل الهواء والنار فيهما: وتتولد المعادن مع صعود الأبخرة والأدخنة منهما. وببقاء المعادن في باطن الأرض، مع وجود قوة الحرارة، يخرج كل شيء حي في الوجود، وتنشأ الأصباغ المختلفة بحسب درجة النضج في الطبيعة. كما يورد كلام جابر بن حيان في إذابة الملح والسكر بالماء.