كان من أشهر الأطباء، وتميز بثقافته الواسعة إلى جانب دقته وأمانته العلمية، انقطع في أواخر حياته للتأليف والتدريس، وكان الطلاب يأتون إليه من كل مكان ليتعلموا على يديه، فكان مرجعا طبيا للباحثين وطلاب العلم، ومما قدمه السمرقندي في خدمة العلوم الطبية؛ أنه كان يعتمد على التجربة العلمية. ومن أهم إسهاماته الطبية تأليفه لكتاب "الأسباب والعلامات في الطب" الذي يثني عليه حاجي خليفة قائلًا "جمع فيه جميع العلل والأمراض الجزئية على سبيل الاستقصاء؛ حتى لا يشذ منها علة مع أسبابها وعلاماتها، وأردف كل نوع بعلاج مجمل نقلًا من كتب الطب"، ومما زاد من أهمية هذا الكتاب وشهرته؛ الشرح الذي قام به برهان الدين نفيس بن عوض بن حكيم للكتاب والذي فرغ منه عام 827هـ بسمرقند في أواخر صفر، وأهداه إلى السلطان ألوغ بك. ومن أشهر كتبه أيضا كتاب النجيبيات: ويتكون من ستة أقسام، تبحث في أسباب الأمراض وعلامتها، والأدوية المفردة، والأغذية والأشربة، والأدوية المسهلة، وأصول تركيب الأدوية، ونقل فيه عن كتاب القانون لابن سينا وقد تُرجم الكتاب إلى اللغة الإنجليزية، ونُشر مع النص العربي بمدينة فلادلفيا عاصمة ولاية بنسلفانيا عام 1387هـ / 1967م.